Kara Kuvveleri Komutanı Orgeneral İlker Başbuğ, Ergenekon operasyonu gözaltılarının, Başbakan Recep Tayyip Erdoğan ile yaptığı görüşmeyle ilişkilendirilmesine yönelik haber ve yorumların gerçekleri yansıtmadığını belirterek, bu girişimleri komplo teorisi olarak nitelendirdi. Başbuğ, Türkiye'nin zor günler geçirdiğini belirterek, herkesi sağduyulu ve soğukkanlı olmaya çağırdı.
İşte Org. Bağbuğ'un açıklaması: "Dün savcının isteği üzerine bazı gözaltıların yaşandığnıı gördük. Medyada bu gözaltılarla ilgili yer alan bazı haber ve yorumların 24 Haziran'da Başbakanlık'ın isteği üzerine Genelkurmay Başkanlığı'nın izni ile yapılan görüşmeyle ilişkilendirildi. Sayın Başbakan'ın talebi üzerine Genelkurmay Başkanı'mızın bilgisiyle gerçekleşen toplantı konusunda bir ilişki kurma konusunda bazı yorum, ima ve haberlerin yapıldığını üzüntüyle gördüm. Yapılan bu yorum ima ve değerlendirmeler kesinlikle gerçek dışıdır. Söz konusu yapılan toplantıda bu konu gündeme gelmemiştir. Hiçbir şekilde gündeme gelmemiştir. Zaten gelmesi de mümkün değildir.
O zaman bu yapılan yorum, ima ve değerlendirmelere ancak komplo teorisi denilebilir. Bu komplo teorisini yapanların hepsinin kötü niyetli olduğunu düşünmek istemiyorum. Bu komplo teorilerini üretenlerin hepsinin kötü niyetli olduklarını düşünmek istemiyorumç Ancak bu teorileri üretenlere şunu sormakta yarar var: "Yapılan kompolo teorileri TSK'nın birlik bütünlüğüne zarar vermeye yönelik bazı amaçlara hizmet etmiyor mu? Acaba komplo teorilerini üretenler bu amaca bilerek ya da bilmeyerek hizmet etmiş olmuyorlar mı? Gereken hassasşiyeti göstermek yalnız TSK personeline ait bir görev değil herkesin üzerinde durması gereken bi husustur. Türkiye olarak zor günlerden geçiyoruz. Hepimiz bu zor dönemde daha sağduyulu, daha soğukkanlı, daha dikkatli ve daha sorumlu davranmak zorundayız. Burada görsel ve yazılı medyamıza görev ve sorumluluk düşmektedir. "