Orgeneral Işık’ın istifasının neden olduğuna dair değişik iddialar var:
1- Silah arkadaşı Org. Hasan Iğsız’ın emekliye sevki ile yerine gelmesinden rahatsız oldu, emekliliğini istedi.
2- Yeni Genelkurmay Başkanı olması beklenen Org. Koşaner, birlikte çalışmak istemedi emekliliğini istedi.
3- Genelkurmay Başkanı Org. İlker Başbuğ’un hükümetin karşısında manevra kabiliyetini arttırabilmek ve Iğsız’ın KKK’ya gelmesini zorlamak için taktik emeklilik ricasında bulundu, Org. Işık da emekliliğini istedi.