Valentino Rossi, Jerez'deki resmi sıralamalarda Dani Pedrosa'yı geçerek en hızlı pilot oldu. Yamaha sürücüsü Rossi ve Repsol Honda'dan Pedrosa, yarışın başından sonuna kadar çekişen ve dikkatleri üzerlerine toplayan iki pilot olarak boy gösterdi. Rossi, yeni sezonun başlamasından hemen önce rakiplerine şu göndermelerde bulundu: "Bu mükemmel bir durum. Bu galibiyetin şampiyona açısından herhangi bir önemi olmasa da, şu açıdan çok önemli ki, motor mükemmel bir durumda ve geçen seneye nazaran çok daha iyi bir performans sergileyecek."
Pedrosa ve Rossi, sıralamaların ilk 20 dakikasında birbirleriyle kıyasıya mücadele etti ve liderlik sürekli yer değiştirdi. Pedrosa geçen yıl Jerez'de elde ettiği 1:38.934 saniyelik kendi tur zamanını egale ederken, Rossi de uyguladığı müthiş baskı ile Pedrosa'yı geride bırakmayı başardı.
Yamaha M1'in set-up'ında yapılan yenilik ve iyileştirmeler, Rossi'nin ilk 7 içinde 1:38.786 tur zamanı yaparak pole pozisyonunu elde etmesinin önünü açtı. Pedrosa ise, 0.006 saniyelik bir zamanla Rossi'nin ardında yer aldı.
Colin Edwards ise, şampiyon Nicky Hayden'ı geçip ikinci Yamaha olarak 3.'lüğü elde etti. Randy de Puniet, Kawasaki'sini büyük bir ezicilikle 5. sıraya oturttu. Onun ardından da Ducati Marlboros ve Chris Vermeulen geldi.
Parasal olarak iyi imkanlarla donanmış olan Team Roberts da, Kenny Roberts Jr. ile 9.'luk pozisyonunu elde etti. Carlos Checa ilk 10 sırayı tamamlayan son pilot oldu. Cuma ve Cumartesi harika sürüş gerçekleştiren Marco Melandri ise ancak 14. olabildi.