Ünlü teknik direktör Pep Guardiola'nın ısrarla istemesi sonrası Borussia Dortmund ile görüşmelere başlayan Manchester City, İlkay Gündoğan'ın transferi için 26 milyon euroluk bonservis bedeli karşılığında anlaşmaya vardı. Transferi önce İlkay Gündoğan, ardından da Manchester City resmi olarak açıkaldı.
Sakatlığı bulunan İlkay Gündoğan'ın, EURO 2016 ile birlikte Premier Lig'in ilk birkaç haftasında da forma giyemeyeceği belirtildi. Transferi hakkında konuşan İlkay; "Bu transferde en kritik konu Pep Guardiola oldu. Pep Guardiola ile çalışmak için Dortmund'dan ayrıldım, Dortmund için en iyisini diliyorum" dedi.
Bu sezon Dortmund'da 40 maçta sahada yer alan 25 yaşındaki orta saha, 3 gol ve 7 asistlik bir performans sergiledi.