İlk yerleştirme sonucunda açık kalan kontenjanlara, sınavda OKS-TM veya OKS-MF puan türlerinden 160 ve üstü puan almasına rağmen tercih ettiği okullardan herhangi birini kazanamayanlar, kesin kayıt hakkı kazandığı halde kaydını yaptırmamış olanlar ve kesin kayıt yaptırdığı halde 29 Temmuz-4 Ağustos 2006 tarihleri arasında kaydını sildirerek sisteme işletenler başvuruda bulunabilecek.
Açık kalan kontenjan sayılarını gösteren belgeler, MEB'in internet adresinde yayımlanıyor. Adaylar 2. Yerleştirme için başvurularını, daha önce başvurdukları okullardan yapabilecek. Adaylar, 2. Yerleştirmede önceki tercihlerine bağlı kalmaksızın en fazla 8 yeni tercih yapabilecek.
MEB, 2. Yerleştirme sonuçlarını 20 Ağustos 2006 tarihinde "meb.gov.tr" internet adresinden açıklayacak.