Normal sezonda gruplarını ilk 4 sırada tamamlayan toplam 16 takımın katılacağı, Türk ekipleri Fenerbahçe Ülker ile Efes Pilsen'in de yer alacağı 'Top 16' kura çekimi TSİ 14.00'de başlayacak. Fenerbahçe Ülker, 'Top 16' kuralarına ikinci, Efes Pilsen ise üçüncü torbadan katılacak.
Dörderli 4 ayrı grupta oynanacak 'Top 16' maçları, 19 Ocak-3 Mart 2011 tarihleri arasında yapılacak. Gruplarını ilk 2 sırada tamamlayacak takımlar, 22 Mart-6 Nisan 2011 tarihlerinde play-off çeyrek finalinde karşılaşacak. Play-off turundan çıkan 4 takım, 6-8 Mayıs 2011'de Barcelona'da Palau San Jordi'deki dörtlü finalde mücadele etme hakkını kazanacak.
THY Avrupa Ligi'nde 'Top 16' kuralarının torbaları şöyle: 1. Torba: Maccabi Tel Aviv, Olympiakos, Montepaschi Siena, Panathinaikos
2. Torba: Caja Laboral, Real Madrid, Fenerbahçe Ülker, Union Olimpija
3. Torba: Zalgiris Kaunas, Unicaja Malaga, Regal Barcelona, Efes Pilsen
4. Torba: Partizan, Lottomatica Roma, Lietuvos Rytas, Power Electronics Valencia
Bu arada Fenerbahçe Ülker ilk turda (C) Grubu'nda mücadele ettiği Montepaschi Siena, Regal Barcelona ve Lietuvos Rytas ile Efes Pilsen de (D) Grubu'nda karşılaştığı Panathinaikos, Union Olimpija ve Power Electronics Valencia takımlarıyla 'Top 16'da eşleşmeyecek.