Şimdiden söyleyelim, eğer henüz filmi izlemediyseniz, içerisinde bazı spoiler’lar olabilir. Zira film, büyük ölçüde orijinal müsveddeyi kullanmış. Yalnız içerisinde bazı farklılıklar var. Ben ve Reed’in ilişkisi az çok benzer. Müsveddede, Reed ve Victor üniversitede tanışıyorlar. Victor inceden Reed’in araştırmalarını Latveriya’ya satıyor, Sue da Baxter binasında Dr. Elder ile birlikte yapay yaşam üzerine çalışıyor. Bu yapay yaşam, sonradan ikonik Fantastic Four düşmanları Moloid’ler olarak geliyorlar filme.
Negative Zone’a ulaşmak isteyen Reed ve Victor’a okuldan izin çıkmıyor, bu yüzden gizli denemeye karar veriyorlar. Reed destek olması için o sırada ordu mensubu olan Ben’i, Susan da kardeşi Johnny’yi çağırıyor. Portaldan Victor, Reed ve Ben geçiyorlar. Karşılarında yıkık bir uzaylı şehri buluyorlar. Şehrin içerisinde de Galactus var. Galactus ellerinden Kara Madde fırlatıyor, Victor vuruluyor; ikili de tam kaçarken, Sue ucu ucuna portalı kapatabiliyor ve böylece beşi birden güç kazanıyorlar.
Sonra film dört sene ileri atlıyor. Reed Toyota’ya FantastiCar prototipi satmaya çalışıyor, Ben’i ordu ele geçirmiş, Johnny reality şov yıldızı olmuş, Sue da kendini Baxter’a kapatmış. Sonra Latveria kendi Quantum geçidini yapıyor, yalnız gidenlerin yerine tamamen Dark Matter ile kaplanmış ve artık Galactus’un elçisi olmuş Doom dönüyor. Bu sırada Dr. Elder Mole Man’e dönüşüyor, Reed Fantasticar’a atlayıp geliyor, Johnny kameralarla iştirak ediyor ve komple ekip beraber dövüşüp karşıdaki düşmanı alt etmeye çalışıyorlar.
Son dövüş Latveria’da, Doom’la gerçekleşiyor, fakat bu dövüşün sonunda Doom’un Negative Zone’da mahsur kaldığını, Dünya’ya gelenin bir Doombot olduğunu, Victor’ın da Doombot’unu dünyaya Galactus’u yok etmek için yolladığını öğreniyoruz. Doombot yeniliyor, Fantastic Four toparlanıyor, Reed Galactus tehdidine yönelik gençleri eğitmek için Baxter Binası’nda bir merkez açıyor. Film de öyle kapanıyor...
