Fenerbahçe'ye son olarak genç futbolcu Gökhan Gönül'ü satan Gençlerbirliği, adeta Sarı-lacivertli ekibin futbolcu fabrikası oldu. Fenerbahçe, son 14 sezonda Gençlerbirliği'nden 10 futbolcu alarak, futbolcu transferinde Kırmızı-siyahlı kulübe adeta abone oldu. Fenerbahçe, son yıllarda hemen hemen her sezon Gençlerbirliği'nden futbolcu transfer etmeyi adet haline getirdi.
Sarı-lacivertliler, 1993-1994 sezonunda Kemalettin Şentürk'ün transferiyle başlayan ve son olarak Gökhan Gönül transferiyle devam eden Gençlerbirliği'nden futbolcu transfer etme furyasında 10 futbolcuya ulaştı. Fenerbahçe, Gençlerbirliği'nden transfer ettiği futbolcular için oldukça yüklü bonservis bedelleri öderken, sadece geçtiğimiz sezon alınan Uğur Boral için para ödemedi.
Fenerbahçe, profesyonel ligler tarihinde ilk olarak Gençlerbirliği'nden Abdullah Çevrim'i transfer ederken, son yıllardaki futbolcu transferleri ise Kemalettin Şentürk ile başladı. 1993-1994 sezonunda savunmada ve orta sahada oynayan Kemalettin'i başkent ekibinden alan Fenerbahçe, bir sonraki sezonda ise dönemin yıldız futbolcusu Tarık Daşgün'ü renklerine bağladı. 1995-1996 sezonunda o dönem için çok büyük bir para olan 115 milyara Fenerbahçe'ye transfer olan Tarık, Gençlerbirliği'ndeki performasını Fenerbahçe'ye yansıtamadı.
Sarı-lacivertliler, 1998-1999 sezonunda ise Gençlerbirliği'nden 2 futbolcu birden transfer etti. Fenerbahçe, o dönem Gençlerbirliği'nde oynadıkları futbolla beğeni toplayan Metin Diyadin ve Erkan Sözeri'yi kadrosuna kattı. Fenerbahçe, 2001-2002 sezonuda ise Gençlerbirliği'nden Ümit Özat'ı aldı. Fenerbahçe'de uzun yıllar top koşturan ve kaptanlığa kadar yükselen Ümit Özat, sezon başında Alman ekibi FC Köln'e transfer oldu. Sarı-lacivertliler, bir sezon sonra ise savunma oyuncusu İsmail Güldüren'i başkent ekibinden transfer etti. Fenerbahçe'de sakatlıklardan kurtulamayan İsmail Güldüren, daha sonra Gençlerbirliği'ne geri döndü.
Gençlerbirliği ile Fenerbahçe arasındaki transferlerde en hareketli sezonlardan birisi 2004-2005 sezonu oldu. Fenerbahçe, bu sezonda Gençlerbirliği'nin 25 milyara malettiği Serkan Balcı'yı 2.5 milyon dolara transfer etti. Aynı sezon gerçekleşen Deniz Barış transferinde ise 2 kulüp karşı karşıya geldi. Fenerbahçe, Deniz'i sözleşmesi bittiği gerekçesiyle bedava kadrosuna katmak isterken, Gençlerbirliği Başkanı İlhan Cavcav, Deniz ile özel bir protokol imzaladıkların belirterek, Fenerbahçe'den 1 milyon euro istemişti. Fenerbahçe, bu parayı ödemek istemeyince İlhan Cavcav'ın itirazları sonucu Deniz Barış'ın lisansı askıya alınmıştı. Federasyon, daha sonra Gençlerbirliği lehine karar vererek, Fenerbahçe'nin 1 milyon euro ödemesi gerektiğini belirmişti. Gençlerbirliği'ne gerekli parayı ödeyen Fenerbahçe, transferi gerçekleştirmeyi başarmıştı. Bu gelişmelerin ardından Fenerbahçe Kulübü Başkanı Aziz Yıldırım, bundan sonra Gençlerbirliği'nden futbolcu transfer etmeyeceğini açıklamıştı.
Bu açıklamanın ardından bir sezon sonra ise Fenerbahçe, daha önce transferler için yüklü bonservis bedelleri ödediği Gençlerbirliği'nden Uğur Boral'ı ücretsiz olarak transfer etti. Sözleşmesi sona eren Uğur Boral, 2006-2007 sezonunda kendisi Sarı-lacivertli renklere bağlayan sözleşmeyi imzaladı.
Fenerbahçe, son olarak ise kiralık olarak formasını giydiği Gençlerbirliği Oftaşspor'da dikkatleri çeken Gökhan Gönül'ü Gençlerbirliği'nden aldı. Gökhan Gönül için yaklaşık 1.5 milyon euro bonservis bedeli ödeyen Fenerbahçe, Gençlerbirliği'nde son 14 sezondaki 10. futbolcu transferini yapmış oldu.